入睡困难，又称入睡障碍性失眠，是大多数患儿存在的问题，其临床表现为睡前焦虑，难以入睡等。医学上认为是睡眠调节中枢位于下丘脑腹前区，即视交叉上核导致的睡眠-觉醒周期紊乱。

根据睡眠专家建议的人体生物钟最佳睡眠时间为22点前入睡，而睡眠阻抗是指患儿在睡前抗拒睡觉，表现为睡前烦躁不安。

部分自闭症孩子在入睡后会反复发生呼吸停顿或低通气，这个过程会使患儿在夜间反复睡眠中断，导致睡眠质量下降。

夜醒的孩子大多是由于没有建立其正常的睡眠节律，在夜间很容易惊醒，轻者一般2-3次，重者有4-5次，并伴有哭闹不安。

白天嗜睡也是自闭症孩子常见的睡眠问题之一，该问题最常发生在不活动或单调、重复性活动阶段，如吃饭、说话时。